Бұған қоса шекарада санитарлық, фитосанитарлық және ветеринарлық бақылаулар жойылуы тиіс болған. Бірақ, Қырғызстандағы эпизоотиялық жағдайға байланысты, Қазақстан бұл мәселенің шешімін кейінге қалдырды. 2015 жылы қарашада Қазақстан санитарлық және фитосанитарлық бақылауды Қырғызстан шекарасынан алып тастады. Енді ветеринарлық бақылау мәселесін шешу керек болады.
Қырғыз үкіметі одақпен интеграцияда бірқатар қиындықтар бар екенін мойындайды.